首先，我们进入custombuild目录：

cd /usr/local/directadmin/custombuild/

然后，编辑options.conf：

vim options.conf

设置 clean=yes ， php5_ver=5.3

然后，开始升级过程：
./build clean
./build update
./build all y

最后，别忘记重启httpd：
service httpd restart

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另外如果升级成高版本的suphp 、cgi模式，需要恢复用户文件权限可以依次输入如下命令批量更改权限

cd /usr/local/directadmin/scripts && ./set_permissions.sh user_homes

find /home/*/domains/*/public_html -type d -print0 | xargs -0 chmod 711

find /home/*/domains/*/public_html -type f -print0 | xargs -0 chmod 644

cd /usr/local/directadmin/data/users && for i in `ls`; do { chown -R $i:$i /home/$i/domains/*/public_html;}; done;